山西农业大学果树研究所（山西省农业科学院果树研究所）前身为“山西省果树试验场”，由原山西省农业厅于1956年4月筹备，1957年4月正式成立。为适应全国果树科研和生产发展的新形势，山西省农业建设厅根据山西省人民委员会要求，于1958年10月改建为“山西省果树科学研究所”，隶属山西省农业建设厅领导。1959年2月全省科研机构调整归口，更名为“山西省农业科学院太谷果树研究所”，后名称和隶属关系几经变化。1975年，正式更名为“山西省农业科学院果树研究所”，隶属山西省农业科学院；2019年山西农业大学与山西省农业科学院合署，现隶属于山西农业大学，更名为山西农业大学果树研究所（山西省农业科学院果树研究所）。